Lineage for Species: Bacillus subtilis [TaxId: 1423]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2826024Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2826025Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (34 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2836768Superfamily c.1.11: Enolase C-terminal domain-like [51604] (3 families) (S)
    binds metal ion (magnesium or manganese) in conserved site inside barrel
    N-terminal alpha+beta domain is common to this superfamily
  5. 2836928Family c.1.11.2: D-glucarate dehydratase-like [51609] (15 proteins)
  6. 2836986Protein Hypothetical protein YitF [141844] (1 species)
  7. 2836987Species Bacillus subtilis [TaxId:1423] [141845] (2 PDB entries)
    Uniprot O06741 115-371

PDB entries in Species: Bacillus subtilis [TaxId: 1423]:

  1. Domain(s) for 2gdq:
    1. 2836988Domain d2gdqa1: 2gdq A:119-374 [135020]
      Other proteins in same PDB: d2gdqa2, d2gdqa3, d2gdqa4, d2gdqb2, d2gdqb3, d2gdqb4
    2. 2836989Domain d2gdqb1: 2gdq B:119-374 [135022]
      Other proteins in same PDB: d2gdqa2, d2gdqa3, d2gdqa4, d2gdqb2, d2gdqb3, d2gdqb4
      automated match to d2gdqa1
  2. Domain(s) for 2gge:
    1. 2836990Domain d2ggea1: 2gge A:119-374 [135128]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    2. 2836991Domain d2ggeb1: 2gge B:119-374 [135130]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    3. 2836992Domain d2ggec1: 2gge C:119-374 [135132]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    4. 2836993Domain d2gged1: 2gge D:119-376 [135134]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    5. 2836994Domain d2ggee1: 2gge E:119-374 [135136]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    6. 2836995Domain d2ggef1: 2gge F:119-374 [135138]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    7. 2836996Domain d2ggeg1: 2gge G:119-374 [135140]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg
    8. 2836997Domain d2ggeh1: 2gge H:119-374 [135142]
      Other proteins in same PDB: d2ggea2, d2ggea3, d2ggea4, d2ggeb2, d2ggeb3, d2ggeb4, d2ggec2, d2ggec3, d2ggec4, d2gged2, d2gged3, d2gged4, d2ggee2, d2ggee3, d2ggee4, d2ggef2, d2ggef3, d2ggef4, d2ggeg2, d2ggeg3, d2ggeg4, d2ggeh2, d2ggeh3, d2ggeh4
      automated match to d2gdqa1
      complexed with cl, mg

More info for Species Bacillus subtilis [TaxId:1423] from c.1.11.2 Hypothetical protein YitF

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