Lineage for d2fugw1 (2fug W:1-196)

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2566748Fold d.307: Nqo5-like [143242] (1 superfamily)
    core: alpha-beta(2)-alpha-beta(3); 2 layers, a/b; mixed beta-sheet, order 12534, strands 2 and 5 are parallel
  4. 2566749Superfamily d.307.1: Nqo5-like [143243] (1 family) (S)
  5. 2566750Family d.307.1.1: Nqo5-like [143244] (2 proteins)
    Globular region is covered by PfamB PB121908 from N-end and then by PfamB PB000646; contains extra C-terminal unstructured region, corresponding to Pfam PF00329
  6. 2566751Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 5, Nqo5 [143245] (1 species)
  7. 2566752Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [143246] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56219 1-196
  8. 2566756Domain d2fugw1: 2fug W:1-196 [134169]
    Other proteins in same PDB: d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1
    automatically matched to 2FUG 5:1-196
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fugw1

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (W:) NADH-quinone oxidoreductase chain 5

SCOPe Domain Sequences for d2fugw1:

Sequence, based on SEQRES records: (download)

>d2fugw1 d.307.1.1 (W:1-196) NADH-quinone oxidoreductase chain 5, Nqo5 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
mrlervleearakgypiednglgnlwvvlprerfkeemahykamgfnfladivgldylty
pdprperfavvyelvslpgwkdgdgsrffvrvyvpeedprlptvtdlwgsanflerevyd
lfgivfeghpdlrkiltpedleghplrkdyplgetptlfregryiipaefraaltgkdpg
ltfykggsrkgyrslw

Sequence, based on observed residues (ATOM records): (download)

>d2fugw1 d.307.1.1 (W:1-196) NADH-quinone oxidoreductase chain 5, Nqo5 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
mrlervleearakgypiednglgnlwvvlprerfkeemahykamgfnfladivgldylty
pdprperfavvyelvslpgwkdgdgsrffvrvyvpeedprlptvtdnflerevydlfgiv
feghpdlrkiltpedleghplrkdyplgetptlfregryiipaefraaltgkdpgltfyk
ggsrkgyrslw

SCOPe Domain Coordinates for d2fugw1:

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Timeline for d2fugw1:

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Domains from other chains:
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d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1