Lineage for d2fugu4 (2fug U:96-246)

  1. Root: SCOPe 2.05
  2. 1886641Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (381 folds)
  3. 1906287Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (59 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 1906288Superfamily d.58.1: 4Fe-4S ferredoxins [54862] (7 families) (S)
  5. 1906422Family d.58.1.5: Ferredoxin domains from multidomain proteins [54884] (14 proteins)
    members of this "family" may be more closely related to other ferredoxins than to each other
  6. 1906515Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 3, Nqo3, domain 2 [143254] (1 species)
  7. 1906516Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [143255] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56223 96-246
  8. 1906520Domain d2fugu4: 2fug U:96-246 [134167]
    Other proteins in same PDB: d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1
    automatically matched to 2FUG 3:96-246
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fugu4

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (U:) NADH-quinone oxidoreductase chain 3

SCOPe Domain Sequences for d2fugu4:

Sequence, based on SEQRES records: (download)

>d2fugu4 d.58.1.5 (U:96-246) NADH-quinone oxidoreductase chain 3, Nqo3, domain 2 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
lsdvvreaqagmveftllnhpldcptcdkggacelqdrtveyglyekyyqkgplelpvyt
rfeftrrhvdkhhplspfvildrercihckrcvryfeevpgdevldfiergvhtfigtmd
fglpsgfsgnitdicpvgalldltarfrarn

Sequence, based on observed residues (ATOM records): (download)

>d2fugu4 d.58.1.5 (U:96-246) NADH-quinone oxidoreductase chain 3, Nqo3, domain 2 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
lsdvvreaqagmveftllnhpldcptcdkggacelqdrtveyglyeklpvytrfeftrrh
vdkhhplspfvildrercihckrcvryfeevpgdevldfiergvhtfigtmdfglpsgfs
gnitdicpvgalldltarfrarn

SCOPe Domain Coordinates for d2fugu4:

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Timeline for d2fugu4:

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Domains from other chains:
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d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1