Lineage for d2fuga3 (2fug A:250-333)

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 849709Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 853596Fold d.15: beta-Grasp (ubiquitin-like) [54235] (14 superfamilies)
    core: beta(2)-alpha-beta(2); mixed beta-sheet 2143
  4. 854905Superfamily d.15.13: Nqo1 middle domain-like [142984] (1 family) (S)
    possibly evolved from 2Fe-2S ferredoxins; contains no iron-sulfur cluster
  5. 854906Family d.15.13.1: Nqo1 middle domain-like [142985] (1 protein)
    C-terminal part of Pfam PF01512
  6. 854907Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 1, Nqo1 [142986] (1 species)
  7. 854908Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [142987] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56222 250-333
  8. 854910Domain d2fuga3: 2fug A:250-333 [134136]
    Other proteins in same PDB: d2fug11, d2fug12, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1
    automatically matched to 2FUG 1:250-333
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fuga3

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (A:) NADH-quinone oxidoreductase chain 1

SCOP Domain Sequences for d2fuga3:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2fuga3 d.15.13.1 (A:250-333) NADH-quinone oxidoreductase chain 1, Nqo1 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
klyqisgpvkrpgvyelpmgttfreliyewaggplepiqaiipggsstpplpfteevldt
pmsyehlqakgsmlgtggvilipe

SCOP Domain Coordinates for d2fuga3:

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Timeline for d2fuga3:

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Domains from other chains:
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d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1