Lineage for d2fuga2 (2fug A:7-249)

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2413226Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2494401Fold c.142: Nqo1 FMN-binding domain-like [142018] (1 superfamily)
    3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 3214
  4. 2494402Superfamily c.142.1: Nqo1 FMN-binding domain-like [142019] (1 family) (S)
  5. 2494403Family c.142.1.1: Nqo1 FMN-binding domain-like [142020] (2 proteins)
    N-terminal part of Pfam PF01512
  6. 2494404Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 1, Nqo1 [142021] (1 species)
  7. 2494405Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [142022] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56222 7-249
  8. 2494407Domain d2fuga2: 2fug A:7-249 [134135]
    Other proteins in same PDB: d2fug11, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1
    automatically matched to 2FUG 1:7-249
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fuga2

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (A:) NADH-quinone oxidoreductase chain 1

SCOPe Domain Sequences for d2fuga2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2fuga2 c.142.1.1 (A:7-249) NADH-quinone oxidoreductase chain 1, Nqo1 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
sgldprfertlyahvgkegswtldyylrhggyetakrvlkektpdevieevkrsglrgrg
gagfptglkwsfmpkddgkqhylicnadesepgsfkdryiledvphlliegmilagyair
atvgyiyvrgeyrraadrleqaikearargylgknlfgtdfsfdlhvhrgagayicgeet
almnsleglranprlkppfpaqsglwgkpttinnvetlasvvpimergadwfaqmgteqs
kgm

SCOPe Domain Coordinates for d2fuga2:

Click to download the PDB-style file with coordinates for d2fuga2.
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Timeline for d2fuga2:

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Domains from other chains:
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d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1