Lineage for d2fug21 (2fug 2:3-180)

  1. Root: SCOPe 2.05
  2. 1815291Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 1852416Fold c.47: Thioredoxin fold [52832] (2 superfamilies)
    core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 4 strands, order 4312; strand 3 is antiparallel to the rest
  4. 1852417Superfamily c.47.1: Thioredoxin-like [52833] (24 families) (S)
  5. 1854369Family c.47.1.21: NQO2-like [142405] (2 proteins)
    complex I 24 kDa subunit; contains 2Fe-2S cluster in the active site; includes extra N-terminal four-helical bundle
    automatically mapped to Pfam PF01257
  6. 1854370Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 2, NQO2 [142406] (1 species)
  7. 1854371Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [142407] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56221 2-179
  8. 1854372Domain d2fug21: 2fug 2:3-180 [134124]
    Other proteins in same PDB: d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fug21

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (2:) NADH-quinone oxidoreductase chain 2

SCOPe Domain Sequences for d2fug21:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2fug21 c.47.1.21 (2:3-180) NADH-quinone oxidoreductase chain 2, NQO2 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
ffddkqdfleetfakyppegrraaimpllrrvqqeegwirperieeiarlvgttptevmg
vasfysyyqfvptgkyhlqvcatlscklagaeelwdyltetlgigpgevtpdglfsvqkv
eclgschtapviqvndepyvecvtrarleallaglragkrleeielpgkcghhvheve

SCOPe Domain Coordinates for d2fug21:

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Timeline for d2fug21:

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d2fug11, d2fug12, d2fug13, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1