Lineage for d2fug11 (2fug 1:334-438)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 1976409Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 1992366Fold a.29: Bromodomain-like [47363] (15 superfamilies)
    4 helices; bundle; minor mirror variant of up-and-down topology
  4. 1993321Superfamily a.29.12: Nqo1C-terminal domain-like [140490] (2 families) (S)
    contains extra C-terminal helix that caps the bundle at one end and Fe4-S4 cluster at the other end
  5. 1993322Family a.29.12.1: Nqo1C-terminal domain-like [140491] (1 protein)
    PfamB PB000336; sequence similarity to the Fe4-S4 ferredoxins in the cluser-binding site
  6. 1993323Protein NADH-quinone oxidoreductase chain 1, Nqo1 [140492] (1 species)
  7. 1993324Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [140493] (1 PDB entry)
    Uniprot Q56222 334-438
  8. 1993325Domain d2fug11: 2fug 1:334-438 [134121]
    Other proteins in same PDB: d2fug12, d2fug13, d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1
    complexed with fes, fmn, sf4

Details for d2fug11

PDB Entry: 2fug (more details), 3.3 Å

PDB Description: crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex i from thermus thermophilus
PDB Compounds: (1:) NADH-quinone oxidoreductase chain 1

SCOPe Domain Sequences for d2fug11:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2fug11 a.29.12.1 (1:334-438) NADH-quinone oxidoreductase chain 1, Nqo1 {Thermus thermophilus [TaxId: 274]}
rvsmvdamwnltrfyahescgkctpcregvagfmvnlfakigtgqgeekdvenleallpl
iegrsfcpladaavwpvkgslrhfkdqylalarekrpvprpslwr

SCOPe Domain Coordinates for d2fug11:

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Timeline for d2fug11:

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Domains from other chains:
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d2fug21, d2fug31, d2fug32, d2fug33, d2fug34, d2fug41, d2fug51, d2fug61, d2fug71, d2fug91, d2fuga1, d2fuga2, d2fuga3, d2fugb1, d2fugc1, d2fugc2, d2fugc3, d2fugc4, d2fugd1, d2fuge1, d2fugf1, d2fugg1, d2fugh1, d2fugj1, d2fugj2, d2fugj3, d2fugk1, d2fugl1, d2fugl2, d2fugl3, d2fugl4, d2fugm1, d2fugn1, d2fugo1, d2fugp1, d2fugq1, d2fugs1, d2fugs2, d2fugs3, d2fugt1, d2fugu1, d2fugu2, d2fugu3, d2fugu4, d2fugv1, d2fugw1, d2fugx1, d2fugy1, d2fugz1