SCOPe 2.07: Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

Root: SCOPe 2.07
Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
Fold b.40: OB-fold [50198] (17 superfamilies)
barrel, closed or partly opened n=5, S=10 or S=8; greek-key
Superfamily b.40.4: Nucleic acid-binding proteins [50249] (18 families)
Family b.40.4.5: Cold shock DNA-binding domain-like [50282] (32 proteins)
barrel, closed; n=5, S=8
Protein C-terminal domain of RNA polymerase II subunit RBP7 (RpoE) [88670] (3 species)
Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [117195] (6 PDB entries)
Uniprot P34087

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

Domain(s) for 1y14:
1. Domain d1y14b1: 1y14 B:81-171 [116323]
  Other proteins in same PDB: d1y14a_, d1y14b2, d1y14c_, d1y14d2
2. Domain d1y14d1: 1y14 D:81-171 [116326]
  Other proteins in same PDB: d1y14a_, d1y14b2, d1y14c_, d1y14d2

Domain(s) for 2b8k:

Domain d2b8kg1: 2b8k G:81-171 [128084]
Other proteins in same PDB: d2b8ka1, d2b8kb1, d2b8kc1, d2b8kc2, d2b8kd1, d2b8ke1, d2b8ke2, d2b8kf1, d2b8kg2, d2b8kh1, d2b8ki1, d2b8ki2, d2b8kj1, d2b8kk1, d2b8kl1
automatically matched to d1y14b1
complexed with zn

Domain(s) for 2ja5:

Domain d2ja5g1: 2ja5 G:81-171 [138166]
Other proteins in same PDB: d2ja5a1, d2ja5b1, d2ja5c1, d2ja5c2, d2ja5d1, d2ja5e1, d2ja5e2, d2ja5f1, d2ja5g2, d2ja5h1, d2ja5i1, d2ja5i2, d2ja5j1, d2ja5k1, d2ja5l1
automatically matched to d1y14b1
protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn

Domain(s) for 2ja6:

Domain d2ja6g1: 2ja6 G:81-171 [138182]
Other proteins in same PDB: d2ja6a1, d2ja6b1, d2ja6c1, d2ja6c2, d2ja6d1, d2ja6e1, d2ja6e2, d2ja6f1, d2ja6g2, d2ja6h1, d2ja6i1, d2ja6i2, d2ja6j1, d2ja6k1, d2ja6l1
automatically matched to d1y14b1
protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn

Domain(s) for 2ja7:

Domain d2ja7g1: 2ja7 G:81-171 [138198]
Other proteins in same PDB: d2ja7a1, d2ja7b1, d2ja7c1, d2ja7c2, d2ja7d1, d2ja7e1, d2ja7e2, d2ja7f1, d2ja7g2, d2ja7h1, d2ja7i1, d2ja7i2, d2ja7j1, d2ja7k1, d2ja7l1, d2ja7m1, d2ja7n1, d2ja7o1, d2ja7o2, d2ja7p1, d2ja7q1, d2ja7q2, d2ja7r1, d2ja7s2, d2ja7t1, d2ja7u1, d2ja7u2, d2ja7v1, d2ja7w1, d2ja7x1
automatically matched to d1y14b1
protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn

Domain d2ja7s1: 2ja7 S:81-171 [138214]
Other proteins in same PDB: d2ja7a1, d2ja7b1, d2ja7c1, d2ja7c2, d2ja7d1, d2ja7e1, d2ja7e2, d2ja7f1, d2ja7g2, d2ja7h1, d2ja7i1, d2ja7i2, d2ja7j1, d2ja7k1, d2ja7l1, d2ja7m1, d2ja7n1, d2ja7o1, d2ja7o2, d2ja7p1, d2ja7q1, d2ja7q2, d2ja7r1, d2ja7s2, d2ja7t1, d2ja7u1, d2ja7u2, d2ja7v1, d2ja7w1, d2ja7x1
automatically matched to d1y14b1
protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn

Domain(s) for 2ja8:

Domain d2ja8g1: 2ja8 G:81-171 [138230]
Other proteins in same PDB: d2ja8a1, d2ja8b1, d2ja8c1, d2ja8c2, d2ja8d1, d2ja8e1, d2ja8e2, d2ja8f1, d2ja8g2, d2ja8h1, d2ja8i1, d2ja8i2, d2ja8j1, d2ja8k1, d2ja8l1
automatically matched to d1y14b1
protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, zn

More info for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.40.4.5 C-terminal domain of RNA polymerase II subunit RBP7 (RpoE)

Timeline for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.40.4.5 C-terminal domain of RNA polymerase II subunit RBP7 (RpoE):

Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.40.4.5 C-terminal domain of RNA polymerase II subunit RBP7 (RpoE) first appeared in SCOP 1.71
Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.40.4.5 C-terminal domain of RNA polymerase II subunit RBP7 (RpoE) appears in SCOPe 2.06