Lineage for Species: African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId: 8355]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2075417Fold b.121: Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) [88632] (7 superfamilies)
    sandwich; 8 strands in 2 sheets; jelly-roll; some members can have additional 1-2 strands
    characteristic interaction between the domains of this fold allows the formation of five-fold and pseudo six-fold assemblies
  4. 2075546Superfamily b.121.3: Nucleoplasmin-like core domain [69203] (2 families) (S)
    oligomerizes into a pentameric ring structure
  5. 2075547Family b.121.3.1: Nucleoplasmin-like core domain [69204] (4 protein domains)
    automatically mapped to Pfam PF03066
  6. 2075555Protein Nucleophosmin (NO38) [117086] (1 species)
  7. 2075556Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] [117087] (2 PDB entries)
    Uniprot P07222 16-122

PDB entries in Species: African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId: 8355]:

  1. Domain(s) for 1xb9:
    1. 2075567Domain d1xb9a1: 1xb9 A:16-122 [115066]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    2. 2075568Domain d1xb9b1: 1xb9 B:16-121 [115067]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    3. 2075569Domain d1xb9c1: 1xb9 C:16-120 [115068]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    4. 2075570Domain d1xb9d1: 1xb9 D:16-119 [115069]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    5. 2075571Domain d1xb9e1: 1xb9 E:16-120 [115070]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    6. 2075572Domain d1xb9f1: 1xb9 F:16-120 [115071]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    7. 2075573Domain d1xb9g1: 1xb9 G:16-121 [115072]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    8. 2075574Domain d1xb9h1: 1xb9 H:16-122 [115073]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    9. 2075575Domain d1xb9i1: 1xb9 I:16-121 [115074]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
    10. 2075576Domain d1xb9j1: 1xb9 J:16-121 [115075]
      Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  2. Domain(s) for 1xe0:
    1. 2075557Domain d1xe0a1: 1xe0 A:16-120 [115197]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    2. 2075558Domain d1xe0b1: 1xe0 B:16-121 [115198]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    3. 2075559Domain d1xe0c_: 1xe0 C: [115199]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    4. 2075560Domain d1xe0d1: 1xe0 D:16-119 [115200]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    5. 2075561Domain d1xe0e1: 1xe0 E:16-120 [115201]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    6. 2075562Domain d1xe0f1: 1xe0 F:16-122 [115202]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    7. 2075563Domain d1xe0g1: 1xe0 G:16-119 [115203]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    8. 2075564Domain d1xe0h1: 1xe0 H:16-120 [115204]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    9. 2075565Domain d1xe0i1: 1xe0 I:16-120 [115205]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
    10. 2075566Domain d1xe0j1: 1xe0 J:16-120 [115206]
      Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2

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