SCOPe 2.08: Protein: Nucleophosmin (NO38)

Lineage for Protein: Nucleophosmin (NO38)

Root: SCOPe 2.08
Class b: All beta proteins [48724] (180 folds)

Fold b.121: Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins) [88632] (7 superfamilies)
sandwich; 8 strands in 2 sheets; jelly-roll; some members can have additional 1-2 strands
characteristic interaction between the domains of this fold allows the formation of five-fold and pseudo six-fold assemblies

Superfamily b.121.3: Nucleoplasmin-like core domain [69203] (2 families)
oligomerizes into a pentameric ring structure
Family b.121.3.1: Nucleoplasmin-like core domain [69204] (4 proteins)
automatically mapped to Pfam PF03066
Protein Nucleophosmin (NO38) [117086] (1 species)

Species:

African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] [117087] (2 PDB entries)
Uniprot P07222 16-122
1. Domains for 1xb9:
  1. Domain d1xb9a1: 1xb9 A:16-122 [115066]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  2. Domain d1xb9b1: 1xb9 B:16-121 [115067]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  3. Domain d1xb9c1: 1xb9 C:16-120 [115068]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  4. Domain d1xb9d1: 1xb9 D:16-119 [115069]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  5. Domain d1xb9e1: 1xb9 E:16-120 [115070]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  6. Domain d1xb9f1: 1xb9 F:16-120 [115071]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  7. Domain d1xb9g1: 1xb9 G:16-121 [115072]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  8. Domain d1xb9h1: 1xb9 H:16-122 [115073]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  9. Domain d1xb9i1: 1xb9 I:16-121 [115074]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
  10. Domain d1xb9j1: 1xb9 J:16-121 [115075]
    Other proteins in same PDB: d1xb9a2, d1xb9b2, d1xb9c2, d1xb9d2, d1xb9e2, d1xb9f2, d1xb9g2, d1xb9h2, d1xb9i2, d1xb9j2
2. Domains for 1xe0:
  1. Domain d1xe0a1: 1xe0 A:16-120 [115197]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  2. Domain d1xe0b1: 1xe0 B:16-121 [115198]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  3. Domain d1xe0c_: 1xe0 C: [115199]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  4. Domain d1xe0d1: 1xe0 D:16-119 [115200]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  5. Domain d1xe0e1: 1xe0 E:16-120 [115201]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  6. Domain d1xe0f1: 1xe0 F:16-122 [115202]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  7. Domain d1xe0g1: 1xe0 G:16-119 [115203]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  8. Domain d1xe0h1: 1xe0 H:16-120 [115204]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  9. Domain d1xe0i1: 1xe0 I:16-120 [115205]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2
  10. Domain d1xe0j1: 1xe0 J:16-120 [115206]
    Other proteins in same PDB: d1xe0a2, d1xe0b2, d1xe0d2, d1xe0e2, d1xe0f2, d1xe0g2, d1xe0h2, d1xe0i2, d1xe0j2

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Protein Nucleophosmin (NO38) from b.121.3.1: Nucleoplasmin-like core domain first appeared in SCOP 1.71
Protein Nucleophosmin (NO38) from b.121.3.1: Nucleoplasmin-like core domain appears in SCOPe 2.07