Lineage for Species: Archaeoglobus fulgidus [TaxId: 2234]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
  3. Fold d.75: MutS N-terminal domain-like [55266] (2 superfamilies)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha-beta(2); 2 layers, alpha/beta
  4. Superfamily d.75.1: tRNA-intron endonuclease N-terminal domain-like [55267] (1 family) (S)
  5. Family d.75.1.1: tRNA-intron endonuclease N-terminal domain-like [55268] (2 proteins)
  6. Protein Dimeric tRNA splicing endonuclease, domains 1 and 3 [103073] (1 species)
    duplication: one subunit consists of two tetrameric tRNA splicing endonuclease subunit-like repeats
  7. Species Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] [103074] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeoglobus fulgidus [TaxId: 2234]:

  1. Domain(s) for 1r0v:
    1. Domain d1r0va3: 1r0v A:140-214 [96744]
      Other proteins in same PDB: d1r0va1, d1r0va2, d1r0vb1, d1r0vb2, d1r0vc1, d1r0vc2, d1r0vd1, d1r0vd2
    2. Domain d1r0vb3: 1r0v B:140-214 [96747]
      Other proteins in same PDB: d1r0va1, d1r0va2, d1r0vb1, d1r0vb2, d1r0vc1, d1r0vc2, d1r0vd1, d1r0vd2
    3. Domain d1r0vc3: 1r0v C:140-214 [96750]
      Other proteins in same PDB: d1r0va1, d1r0va2, d1r0vb1, d1r0vb2, d1r0vc1, d1r0vc2, d1r0vd1, d1r0vd2
    4. Domain d1r0vd3: 1r0v D:140-214 [96753]
      Other proteins in same PDB: d1r0va1, d1r0va2, d1r0vb1, d1r0vb2, d1r0vc1, d1r0vc2, d1r0vd1, d1r0vd2
  2. Domain(s) for 1r11:
    1. Domain d1r11a3: 1r11 A:3-60 [96774]
      Other proteins in same PDB: d1r11a1, d1r11a2, d1r11b1, d1r11b2
    2. Domain d1r11a4: 1r11 A:140-214 [96775]
      Other proteins in same PDB: d1r11a1, d1r11a2, d1r11b1, d1r11b2
    3. Domain d1r11b3: 1r11 B:3-60 [96778]
      Other proteins in same PDB: d1r11a1, d1r11a2, d1r11b1, d1r11b2
    4. Domain d1r11b4: 1r11 B:140-214 [96779]
      Other proteins in same PDB: d1r11a1, d1r11a2, d1r11b1, d1r11b2
  3. Domain(s) for 1rlv:
    1. Domain d1rlva3: 1rlv A:2-60 [97654]
      Other proteins in same PDB: d1rlva1, d1rlva2, d1rlvb1, d1rlvb2
    2. Domain d1rlva4: 1rlv A:140-214 [97655]
      Other proteins in same PDB: d1rlva1, d1rlva2, d1rlvb1, d1rlvb2
    3. Domain d1rlvb3: 1rlv B:2-60 [97658]
      Other proteins in same PDB: d1rlva1, d1rlva2, d1rlvb1, d1rlvb2
    4. Domain d1rlvb4: 1rlv B:140-214 [97659]
      Other proteins in same PDB: d1rlva1, d1rlva2, d1rlvb1, d1rlvb2
  4. Domain(s) for 2gjw:
    1. Domain d2gjwa3: 2gjw A:5-63 [135297]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1rlva3
      protein/RNA complex
    2. Domain d2gjwa4: 2gjw A:143-217 [135298]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1r0va3
      protein/RNA complex
    3. Domain d2gjwb3: 2gjw B:5-62 [135301]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1rlva3
      protein/RNA complex
    4. Domain d2gjwb4: 2gjw B:142-216 [135302]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1r0va3
      protein/RNA complex
    5. Domain d2gjwc3: 2gjw C:5-62 [135305]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1rlva3
      protein/RNA complex
    6. Domain d2gjwc4: 2gjw C:142-216 [135306]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1r0va3
      protein/RNA complex
    7. Domain d2gjwd3: 2gjw D:5-63 [135309]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1rlva3
      protein/RNA complex
    8. Domain d2gjwd4: 2gjw D:143-217 [135310]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa1, d2gjwa2, d2gjwa5, d2gjwb1, d2gjwb2, d2gjwb5, d2gjwc1, d2gjwc2, d2gjwc5, d2gjwd1, d2gjwd2
      automatically matched to d1r0va3
      protein/RNA complex

More info for Species Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] from d.75.1.1 Dimeric tRNA splicing endonuclease, domains 1 and 3

Timeline for Species Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] from d.75.1.1 Dimeric tRNA splicing endonuclease, domains 1 and 3: