Lineage for Species: Archaeoglobus fulgidus [TaxId: 2234]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2121131Fold c.52: Restriction endonuclease-like [52979] (4 superfamilies)
    core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 12345; strands 2 &, in some families, 5 are antiparallel to the rest
  4. 2121679Superfamily c.52.2: tRNA-intron endonuclease catalytic domain-like [53032] (1 family) (S)
  5. 2121680Family c.52.2.1: tRNA-intron endonuclease catalytic domain-like [53033] (3 protein domains)
  6. 2121681Protein Dimeric tRNA splicing endonuclease, domains 2 and 4 [102477] (1 species)
    duplication: one subunit consists of two tetrameric tRNA splicing endonuclease subunit-like repeats
  7. 2121682Species Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] [102478] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Archaeoglobus fulgidus [TaxId: 2234]:

  1. Domain(s) for 1r0v:
    1. 2121683Domain d1r0va1: 1r0v A:62-139 [96742]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    2. 2121684Domain d1r0va2: 1r0v A:215-305 [96743]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    3. 2121685Domain d1r0vb1: 1r0v B:62-139 [96745]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    4. 2121686Domain d1r0vb2: 1r0v B:215-305 [96746]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    5. 2121687Domain d1r0vc1: 1r0v C:62-139 [96748]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    6. 2121688Domain d1r0vc2: 1r0v C:215-305 [96749]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    7. 2121689Domain d1r0vd1: 1r0v D:63-139 [96751]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
    8. 2121690Domain d1r0vd2: 1r0v D:215-305 [96752]
      Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3
  2. Domain(s) for 1r11:
    1. 2121691Domain d1r11a1: 1r11 A:61-139 [96772]
      Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4
    2. 2121692Domain d1r11a2: 1r11 A:215-305 [96773]
      Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4
    3. 2121693Domain d1r11b1: 1r11 B:61-139 [96776]
      Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4
    4. 2121694Domain d1r11b2: 1r11 B:215-305 [96777]
      Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4
  3. Domain(s) for 1rlv:
    1. 2121703Domain d1rlva1: 1rlv A:61-139 [97652]
      Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4
    2. 2121704Domain d1rlva2: 1rlv A:215-305 [97653]
      Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4
    3. 2121705Domain d1rlvb1: 1rlv B:61-139 [97656]
      Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4
    4. 2121706Domain d1rlvb2: 1rlv B:215-305 [97657]
      Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4
  4. Domain(s) for 2gjw:
    1. 2121695Domain d2gjwa1: 2gjw A:64-142 [135295]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r11a1
      protein/RNA complex
    2. 2121696Domain d2gjwa2: 2gjw A:218-308 [135296]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r0va2
      protein/RNA complex
    3. 2121697Domain d2gjwb1: 2gjw B:63-141 [135299]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r11a1
      protein/RNA complex
    4. 2121698Domain d2gjwb2: 2gjw B:217-307 [135300]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r0va2
      protein/RNA complex
    5. 2121699Domain d2gjwc1: 2gjw C:63-141 [135303]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r11a1
      protein/RNA complex
    6. 2121700Domain d2gjwc2: 2gjw C:217-307 [135304]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r0va2
      protein/RNA complex
    7. 2121701Domain d2gjwd1: 2gjw D:64-142 [135307]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r11a1
      protein/RNA complex
    8. 2121702Domain d2gjwd2: 2gjw D:218-308 [135308]
      Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4
      automatically matched to d1r0va2
      protein/RNA complex

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