Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds) |
Fold c.52: Restriction endonuclease-like [52979] (4 superfamilies) core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 12345; strands 2 &, in some families, 5 are antiparallel to the rest |
Superfamily c.52.2: tRNA-intron endonuclease catalytic domain-like [53032] (1 family) |
Family c.52.2.1: tRNA-intron endonuclease catalytic domain-like [53033] (3 proteins) |
Protein Dimeric tRNA splicing endonuclease, domains 2 and 4 [102477] (1 species) duplication: one subunit consists of two tetrameric tRNA splicing endonuclease subunit-like repeats |
Species Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] [102478] (4 PDB entries) |
Domain d1r0va1: 1r0v A:62-139 [96742] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0va2: 1r0v A:215-305 [96743] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0vb1: 1r0v B:62-139 [96745] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0vb2: 1r0v B:215-305 [96746] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0vc1: 1r0v C:62-139 [96748] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0vc2: 1r0v C:215-305 [96749] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0vd1: 1r0v D:63-139 [96751] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r0vd2: 1r0v D:215-305 [96752] Other proteins in same PDB: d1r0va3, d1r0vb3, d1r0vc3, d1r0vd3 |
Domain d1r11a1: 1r11 A:61-139 [96772] Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4 |
Domain d1r11a2: 1r11 A:215-305 [96773] Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4 |
Domain d1r11b1: 1r11 B:61-139 [96776] Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4 |
Domain d1r11b2: 1r11 B:215-305 [96777] Other proteins in same PDB: d1r11a3, d1r11a4, d1r11b3, d1r11b4 |
Domain d1rlva1: 1rlv A:61-139 [97652] Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4 |
Domain d1rlva2: 1rlv A:215-305 [97653] Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4 |
Domain d1rlvb1: 1rlv B:61-139 [97656] Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4 |
Domain d1rlvb2: 1rlv B:215-305 [97657] Other proteins in same PDB: d1rlva3, d1rlva4, d1rlvb3, d1rlvb4 |
Domain d2gjwa1: 2gjw A:64-142 [135295] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r11a1 protein/RNA complex |
Domain d2gjwa2: 2gjw A:218-308 [135296] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r0va2 protein/RNA complex |
Domain d2gjwb1: 2gjw B:63-141 [135299] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r11a1 protein/RNA complex |
Domain d2gjwb2: 2gjw B:217-307 [135300] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r0va2 protein/RNA complex |
Domain d2gjwc1: 2gjw C:63-141 [135303] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r11a1 protein/RNA complex |
Domain d2gjwc2: 2gjw C:217-307 [135304] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r0va2 protein/RNA complex |
Domain d2gjwd1: 2gjw D:64-142 [135307] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r11a1 protein/RNA complex |
Domain d2gjwd2: 2gjw D:218-308 [135308] Other proteins in same PDB: d2gjwa3, d2gjwa4, d2gjwa5, d2gjwb3, d2gjwb4, d2gjwb5, d2gjwc3, d2gjwc4, d2gjwc5, d2gjwd3, d2gjwd4 automatically matched to d1r0va2 protein/RNA complex |
Timeline for Species Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] from c.52.2.1 Dimeric tRNA splicing endonuclease, domains 2 and 4: