Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds) |
Fold c.36: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52517] (1 superfamily) 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213465 |
Superfamily c.36.1: Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) [52518] (8 families) there are two different functional modules of this fold: pyridine-binding (Pyr) and pyrophosphate-binding (PP) modules two Pyr and two PP modules assemble together in a conserved heterotetrameric core that binds two THDP coenzyme molecules |
Family c.36.1.9: Pyruvate oxidase and decarboxylase PP module [88749] (7 proteins) the N-terminal, Pyr module is separated from the C-terminal, PP module by an alpa/beta domain of Rossmann-like topology |
Protein Carboxyethylarginine synthase [102335] (1 species) |
Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] [102336] (3 PDB entries) |
Domain d1upaa3: 1upa A:375-572 [99716] Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa2, d1upab1, d1upab2, d1upac1, d1upac2, d1upad1, d1upad2 |
Domain d1upab3: 1upa B:375-572 [99719] Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa2, d1upab1, d1upab2, d1upac1, d1upac2, d1upad1, d1upad2 |
Domain d1upac3: 1upa C:375-563 [99722] Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa2, d1upab1, d1upab2, d1upac1, d1upac2, d1upad1, d1upad2 |
Domain d1upad3: 1upa D:375-572 [99725] Other proteins in same PDB: d1upaa1, d1upaa2, d1upab1, d1upab2, d1upac1, d1upac2, d1upad1, d1upad2 complexed with mg, so4, tpp |
Domain d1upba3: 1upb A:375-572 [99728] Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba2, d1upbb1, d1upbb2, d1upbc1, d1upbc2, d1upbd1, d1upbd2 |
Domain d1upbb3: 1upb B:375-572 [99731] Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba2, d1upbb1, d1upbb2, d1upbc1, d1upbc2, d1upbd1, d1upbd2 |
Domain d1upbc3: 1upb C:375-563 [99734] Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba2, d1upbb1, d1upbb2, d1upbc1, d1upbc2, d1upbd1, d1upbd2 |
Domain d1upbd3: 1upb D:375-572 [99737] Other proteins in same PDB: d1upba1, d1upba2, d1upbb1, d1upbb2, d1upbc1, d1upbc2, d1upbd1, d1upbd2 complexed with mg, so4, tpp |
Domain d1upca3: 1upc A:375-572 [99740] Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca2, d1upcb1, d1upcb2, d1upcc1, d1upcc2, d1upcd1, d1upcd2, d1upce1, d1upce2, d1upcf1, d1upcf2 |
Domain d1upcb3: 1upc B:375-572 [99743] Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca2, d1upcb1, d1upcb2, d1upcc1, d1upcc2, d1upcd1, d1upcd2, d1upce1, d1upce2, d1upcf1, d1upcf2 |
Domain d1upcc3: 1upc C:375-572 [99746] Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca2, d1upcb1, d1upcb2, d1upcc1, d1upcc2, d1upcd1, d1upcd2, d1upce1, d1upce2, d1upcf1, d1upcf2 |
Domain d1upcd3: 1upc D:375-572 [99749] Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca2, d1upcb1, d1upcb2, d1upcc1, d1upcc2, d1upcd1, d1upcd2, d1upce1, d1upce2, d1upcf1, d1upcf2 |
Domain d1upce3: 1upc E:375-572 [99752] Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca2, d1upcb1, d1upcb2, d1upcc1, d1upcc2, d1upcd1, d1upcd2, d1upce1, d1upce2, d1upcf1, d1upcf2 |
Domain d1upcf3: 1upc F:375-572 [99755] Other proteins in same PDB: d1upca1, d1upca2, d1upcb1, d1upcb2, d1upcc1, d1upcc2, d1upcd1, d1upcd2, d1upce1, d1upce2, d1upcf1, d1upcf2 complexed with mg, so4, tpp |
Timeline for Protein Carboxyethylarginine synthase from c.36.1.9: Pyruvate oxidase and decarboxylase PP module: