Lineage for Species: Streptomyces clavuligerus

  1. Root: SCOP 1.67
  2. 383641Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (130 folds)
  3. 392797Fold c.31: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52466] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
  4. 392798Superfamily c.31.1: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52467] (5 families) (S)
    binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold
  5. 392816Family c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain [52475] (7 proteins)
    N-terminal domain is Pyr module, and C-terminal domain is PP module of thiamin diphosphate-binding fold
  6. 392842Protein Carboxyethylarginine synthase [102290] (1 species)
  7. 392843Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] [102291] (3 PDB entries)

PDB entries in Species: Streptomyces clavuligerus:

  1. Domain(s) for 1upa:
    1. 392844Domain d1upaa1: 1upa A:198-374 [99714]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
    2. 392845Domain d1upab1: 1upa B:198-374 [99717]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
    3. 392846Domain d1upac1: 1upa C:198-374 [99720]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
    4. 392847Domain d1upad1: 1upa D:198-374 [99723]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
  2. Domain(s) for 1upb:
    1. 392848Domain d1upba1: 1upb A:198-374 [99726]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
    2. 392849Domain d1upbb1: 1upb B:198-374 [99729]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
    3. 392850Domain d1upbc1: 1upb C:198-374 [99732]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
    4. 392851Domain d1upbd1: 1upb D:198-374 [99735]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
  3. Domain(s) for 1upc:
    1. 392852Domain d1upca1: 1upc A:198-374 [99738]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
    2. 392853Domain d1upcb1: 1upc B:198-374 [99741]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
    3. 392854Domain d1upcc1: 1upc C:198-374 [99744]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
    4. 392855Domain d1upcd1: 1upc D:198-374 [99747]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
    5. 392856Domain d1upce1: 1upc E:198-374 [99750]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
    6. 392857Domain d1upcf1: 1upc F:198-374 [99753]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp

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