Lineage for Species: Streptomyces clavuligerus [TaxId: 1901]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2107255Fold c.31: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52466] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
  4. 2107256Superfamily c.31.1: DHS-like NAD/FAD-binding domain [52467] (7 families) (S)
    binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold
  5. 2107283Family c.31.1.3: Pyruvate oxidase and decarboxylase, middle domain [52475] (8 protein domains)
    N-terminal domain is Pyr module, and C-terminal domain is PP module of thiamin diphosphate-binding fold
  6. 2107389Protein Carboxyethylarginine synthase [102290] (1 species)
  7. 2107390Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] [102291] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Streptomyces clavuligerus [TaxId: 1901]:

  1. Domain(s) for 1upa:
    1. 2107407Domain d1upaa1: 1upa A:198-374 [99714]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 2107408Domain d1upab1: 1upa B:198-374 [99717]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 2107409Domain d1upac1: 1upa C:198-374 [99720]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 2107410Domain d1upad1: 1upa D:198-374 [99723]
      Other proteins in same PDB: d1upaa2, d1upaa3, d1upab2, d1upab3, d1upac2, d1upac3, d1upad2, d1upad3
      complexed with mg, so4, tpp
  2. Domain(s) for 1upb:
    1. 2107403Domain d1upba1: 1upb A:198-374 [99726]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 2107404Domain d1upbb1: 1upb B:198-374 [99729]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 2107405Domain d1upbc1: 1upb C:198-374 [99732]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 2107406Domain d1upbd1: 1upb D:198-374 [99735]
      Other proteins in same PDB: d1upba2, d1upba3, d1upbb2, d1upbb3, d1upbc2, d1upbc3, d1upbd2, d1upbd3
      complexed with mg, so4, tpp
  3. Domain(s) for 1upc:
    1. 2107411Domain d1upca1: 1upc A:198-374 [99738]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    2. 2107412Domain d1upcb1: 1upc B:198-374 [99741]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    3. 2107413Domain d1upcc1: 1upc C:198-374 [99744]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    4. 2107414Domain d1upcd1: 1upc D:198-374 [99747]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    5. 2107415Domain d1upce1: 1upc E:198-374 [99750]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
    6. 2107416Domain d1upcf1: 1upc F:198-374 [99753]
      Other proteins in same PDB: d1upca2, d1upca3, d1upcb2, d1upcb3, d1upcc2, d1upcc3, d1upcd2, d1upcd3, d1upce2, d1upce3, d1upcf2, d1upcf3
      complexed with mg, so4, tpp
  4. Domain(s) for 2iht:
    1. 2107391Domain d2ihta1: 2iht A:198-374 [147685]
      Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, mg, so4, tpp
    2. 2107392Domain d2ihtb1: 2iht B:198-374 [147688]
      Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, mg, so4, tpp
    3. 2107393Domain d2ihtc1: 2iht C:198-374 [147691]
      Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, mg, so4, tpp
    4. 2107394Domain d2ihtd1: 2iht D:198-374 [147694]
      Other proteins in same PDB: d2ihta2, d2ihta3, d2ihtb2, d2ihtb3, d2ihtc2, d2ihtc3, d2ihtd2, d2ihtd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, mg, so4, tpp
  5. Domain(s) for 2ihu:
    1. 2107395Domain d2ihua1: 2ihu A:198-374 [147697]
      Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
    2. 2107396Domain d2ihub2: 2ihu B:198-374 [198066]
      Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
    3. 2107397Domain d2ihuc2: 2ihu C:198-374 [198069]
      Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
    4. 2107398Domain d2ihud2: 2ihu D:198-374 [198072]
      Other proteins in same PDB: d2ihua2, d2ihua3, d2ihub1, d2ihub3, d2ihuc1, d2ihuc3, d2ihud1, d2ihud3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gol, k, mg, tar, tp8, tp9
  6. Domain(s) for 2ihv:
    1. 2107399Domain d2ihva1: 2ihv A:198-374 [147700]
      Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gva, k, mg, tpp
    2. 2107400Domain d2ihvb1: 2ihv B:198-374 [147703]
      Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gva, k, mg, tpp
    3. 2107401Domain d2ihvc2: 2ihv C:198-374 [198075]
      Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gva, k, mg, tpp
    4. 2107402Domain d2ihvd1: 2ihv D:198-374 [147706]
      Other proteins in same PDB: d2ihva2, d2ihva3, d2ihvb2, d2ihvb3, d2ihvc1, d2ihvc3, d2ihvd2, d2ihvd3
      automated match to d1upaa1
      complexed with gva, k, mg, tpp

More info for Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] from c.31.1.3 Carboxyethylarginine synthase

Timeline for Species Streptomyces clavuligerus [TaxId:1901] from c.31.1.3 Carboxyethylarginine synthase: