Lineage for Species: Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId: 79679]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 1976409Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 2011121Fold a.129: GroEL equatorial domain-like [48591] (1 superfamily)
    multihelical; 8 helices arranged in 2 parallel layers
  4. 2011122Superfamily a.129.1: GroEL equatorial domain-like [48592] (2 families) (S)
    duplication: two 4-helical subdomains are related by a pseudo dyad passing through the ATP-binding site
  5. 2011306Family a.129.1.2: Group II chaperonin (CCT, TRIC), ATPase domain [48596] (1 protein)
  6. 2011307Protein Thermosome, E domain [48597] (3 species)
  7. 2011308Species Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId:79679] [101457] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermococcus sp. ks-1, alpha chain [TaxId: 79679]:

  1. Domain(s) for 1q2v:
    1. 2011313Domain d1q2va1: 1q2v A:9-145,A:406-526 [95643]
      Other proteins in same PDB: d1q2va2, d1q2va3, d1q2vb2, d1q2vb3, d1q2vc2, d1q2vc3, d1q2vd2, d1q2vd3
      complexed with so4
    2. 2011314Domain d1q2vb1: 1q2v B:9-145,B:406-526 [95646]
      Other proteins in same PDB: d1q2va2, d1q2va3, d1q2vb2, d1q2vb3, d1q2vc2, d1q2vc3, d1q2vd2, d1q2vd3
      complexed with so4
    3. 2011315Domain d1q2vc1: 1q2v C:9-145,C:406-526 [95649]
      Other proteins in same PDB: d1q2va2, d1q2va3, d1q2vb2, d1q2vb3, d1q2vc2, d1q2vc3, d1q2vd2, d1q2vd3
      complexed with so4
    4. 2011316Domain d1q2vd1: 1q2v D:9-145,D:406-526 [95652]
      Other proteins in same PDB: d1q2va2, d1q2va3, d1q2vb2, d1q2vb3, d1q2vc2, d1q2vc3, d1q2vd2, d1q2vd3
      complexed with so4
  2. Domain(s) for 1q3q:
    1. 2011309Domain d1q3qa1: 1q3q A:9-145,A:406-526 [95704]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa2, d1q3qa3, d1q3qb2, d1q3qb3, d1q3qc2, d1q3qc3, d1q3qd2, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
    2. 2011310Domain d1q3qb1: 1q3q B:9-145,B:406-526 [95707]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa2, d1q3qa3, d1q3qb2, d1q3qb3, d1q3qc2, d1q3qc3, d1q3qd2, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
    3. 2011311Domain d1q3qc1: 1q3q C:9-145,C:406-526 [95710]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa2, d1q3qa3, d1q3qb2, d1q3qb3, d1q3qc2, d1q3qc3, d1q3qd2, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
    4. 2011312Domain d1q3qd1: 1q3q D:9-145,D:406-526 [95713]
      Other proteins in same PDB: d1q3qa2, d1q3qa3, d1q3qb2, d1q3qb3, d1q3qc2, d1q3qc3, d1q3qd2, d1q3qd3
      complexed with anp, mg; mutant
  3. Domain(s) for 1q3r:
    1. 2011317Domain d1q3ra1: 1q3r A:9-145,A:406-526 [95716]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra2, d1q3ra3, d1q3rb2, d1q3rb3, d1q3rc2, d1q3rc3, d1q3rd2, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
    2. 2011318Domain d1q3rb1: 1q3r B:9-145,B:406-526 [95719]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra2, d1q3ra3, d1q3rb2, d1q3rb3, d1q3rc2, d1q3rc3, d1q3rd2, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
    3. 2011319Domain d1q3rc1: 1q3r C:9-145,C:406-526 [95722]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra2, d1q3ra3, d1q3rb2, d1q3rb3, d1q3rc2, d1q3rc3, d1q3rd2, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
    4. 2011320Domain d1q3rd1: 1q3r D:9-145,D:406-526 [95725]
      Other proteins in same PDB: d1q3ra2, d1q3ra3, d1q3rb2, d1q3rb3, d1q3rc2, d1q3rc3, d1q3rd2, d1q3rd3
      complexed with so4; mutant
  4. Domain(s) for 1q3s:
    1. 2011321Domain d1q3sa1: 1q3s A:10-145,A:406-526 [95728]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    2. 2011322Domain d1q3sb1: 1q3s B:10-145,B:406-526 [95731]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    3. 2011323Domain d1q3sc1: 1q3s C:10-145,C:406-526 [95734]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    4. 2011324Domain d1q3sd1: 1q3s D:10-145,D:406-526 [95737]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    5. 2011325Domain d1q3se1: 1q3s E:10-145,E:406-526 [95740]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    6. 2011326Domain d1q3sf1: 1q3s F:10-145,F:406-526 [95743]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    7. 2011327Domain d1q3sg1: 1q3s G:10-145,G:406-526 [95746]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg
    8. 2011328Domain d1q3sh1: 1q3s H:10-145,H:406-526 [95749]
      Other proteins in same PDB: d1q3sa2, d1q3sa3, d1q3sb2, d1q3sb3, d1q3sc2, d1q3sc3, d1q3sd2, d1q3sd3, d1q3se2, d1q3se3, d1q3sf2, d1q3sf3, d1q3sg2, d1q3sg3, d1q3sh2, d1q3sh3
      complexed with adp, mg

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