PDB entry 6p5t

View 6p5t on RCSB PDB site
Description: surface-layer (s-layer) rsaa protein from caulobacter crescentus bound to strontium and iodide
Deposited on 2019-05-30, released 2020-01-15
The last revision was dated 2020-01-22, with a file datestamp of 2020-01-17.
Experiment type: XRAY
Resolution: 2.1 Å
R-factor: N/A
AEROSPACI score: 0.28 (click here for full SPACI score report)

Chains and heterogens:

  • Chain 'A':
    Compound: S-layer protein
    Species: Caulobacter vibrioides [TaxId:155892]
    Gene: rsaA, CC_1007
    Database cross-references and differences (RAF-indexed):
  • Chain 'B':
    Compound: S-layer protein
    Species: Caulobacter vibrioides [TaxId:155892]
    Gene: rsaA, CC_1007
    Database cross-references and differences (RAF-indexed):
  • Chain 'C':
    Compound: S-layer protein
    Species: Caulobacter vibrioides [TaxId:155892]
    Gene: rsaA, CC_1007
    Database cross-references and differences (RAF-indexed):
  • Chain 'D':
    Compound: S-layer protein
    Species: Caulobacter vibrioides [TaxId:155892]
    Gene: rsaA, CC_1007
    Database cross-references and differences (RAF-indexed):
  • Chain 'E':
    Compound: S-layer protein
    Species: Caulobacter vibrioides [TaxId:155892]
    Gene: rsaA, CC_1007
    Database cross-references and differences (RAF-indexed):
  • Chain 'F':
    Compound: S-layer protein
    Species: Caulobacter vibrioides [TaxId:155892]
    Gene: rsaA, CC_1007
    Database cross-references and differences (RAF-indexed):
  • Heterogens: IOD, SR, HOH

PDB Chain Sequences:
This PDB entry is not classified in SCOPe 2.08, so the chain sequences below are not included in the ASTRAL sequence sets.

  • Chain 'A':
    Sequence, based on SEQRES records:
    >6p5tA (A:)
mtmitnsrgslsdgalstdnaagvnlftaypssgvsgstlslttgtdtltgtanndtfva
gevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptgvtisgietmnvtsgaaitlnts
sgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaannvavdgganvtvastgvtsgtt
tvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtvaqtagnavnttltqadvtvtgns
sttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasattagkiatvtlgsfgaatidssa
lttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltttgaitdseaaaddgfttiniag
stasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltgitvtnsvgatlgaelatglvft
ggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsad
pafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagattftnvavnvgltvlaaptgtttv
tlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvniaatdtnttahvdtltlqatsaks
ivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvsanttvgevvtirggagadsltg
satandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdinaigtstafvtitdaavgdkldl
vgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdss
agatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

    Sequence, based on observed residues (ATOM records):
    >6p5tA (A:)
sgvsgstlslttgtdtltgtanndtfvagevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaav
talptgvtisgietmnvtsgaaitlntssgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltatt
aaqaannvavdgganvtvastgvtsgtttvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtgg
tavtvaqtagnavnttltqadvtvtgnssttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitds
aaasattagkiatvtlgsfgaatidssalttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltln
vngltttgaitdseaaaddgfttiniagstasstiaslvaadattlnisgdarvtitsht
aaaltgitvtnsvgatlgaelatglvftggagadsillgattkaivmgagddtvtvssat
lgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsadpafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlga
tagattftnvavnvgltvlaaptgtttvtlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagv
etvniaatdtnttahvdtltlqatsaksivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgs
avtfvsanttvgevvtirggagadsltgsatandtiiggagadtlvytggtdtftggtga
difdinaigtstafvtitdaavgdkldlvgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqylda
aaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdssagatfvsgadavikltglvtlttsafatevlt
la

  • Chain 'B':
    Sequence, based on SEQRES records:
    >6p5tB (B:)
mtmitnsrgslsdgalstdnaagvnlftaypssgvsgstlslttgtdtltgtanndtfva
gevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptgvtisgietmnvtsgaaitlnts
sgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaannvavdgganvtvastgvtsgtt
tvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtvaqtagnavnttltqadvtvtgns
sttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasattagkiatvtlgsfgaatidssa
lttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltttgaitdseaaaddgfttiniag
stasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltgitvtnsvgatlgaelatglvft
ggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsad
pafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagattftnvavnvgltvlaaptgtttv
tlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvniaatdtnttahvdtltlqatsaks
ivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvsanttvgevvtirggagadsltg
satandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdinaigtstafvtitdaavgdkldl
vgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdss
agatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

    Sequence, based on observed residues (ATOM records):
    >6p5tB (B:)
tlslttgtdtltgtanndtfvagevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptg
vtisgietmnvtsgaaitlntssgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaan
nvavdgganvtvastgvtsgtttvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtva
qtagnavnttltqadvtvtgnssttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasat
tagkiatvtlgsfgaatidssalttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltt
tgaitdseaaaddgfttiniagstasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltg
itvtnsvgatlgaelatglvftggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggs
vnggdgtdvlvanvngssfsadpafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagatt
ftnvavnvgltvlaaptgtttvtlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvnia
atdtnttahvdtltlqatsaksivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvs
anttvgevvtirggagadsltgsatandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdin
aigtstafvtitdaavgdkldlvgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdg
sgtsvakwfqfggdtyvvvdssagatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

  • Chain 'C':
    Sequence, based on SEQRES records:
    >6p5tC (C:)
mtmitnsrgslsdgalstdnaagvnlftaypssgvsgstlslttgtdtltgtanndtfva
gevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptgvtisgietmnvtsgaaitlnts
sgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaannvavdgganvtvastgvtsgtt
tvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtvaqtagnavnttltqadvtvtgns
sttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasattagkiatvtlgsfgaatidssa
lttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltttgaitdseaaaddgfttiniag
stasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltgitvtnsvgatlgaelatglvft
ggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsad
pafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagattftnvavnvgltvlaaptgtttv
tlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvniaatdtnttahvdtltlqatsaks
ivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvsanttvgevvtirggagadsltg
satandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdinaigtstafvtitdaavgdkldl
vgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdss
agatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

    Sequence, based on observed residues (ATOM records):
    >6p5tC (C:)
gvsgstlslttgtdtltgtanndtfvagevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavt
alptgvtisgietmnvtsgaaitlntssgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltatta
aqaannvavdgganvtvastgvtsgtttvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggt
avtvaqtagnavnttltqadvtvtgnssttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsa
aasattagkiatvtlgsfgaatidssalttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnv
ngltttgaitdseaaaddgfttiniagstasstiaslvaadattlnisgdarvtitshta
aaltgitvtnsvgatlgaelatglvftggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatl
gaggsvnggdgtdvlvanvngssfsadpafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgat
agattftnvavnvgltvlaaptgtttvtlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagve
tvniaatdtnttahvdtltlqatsaksivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsa
vtfvsanttvgevvtirggagadsltgsatandtiiggagadtlvytggtdtftggtgad
ifdinaigtstafvtitdaavgdkldlvgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaa
aagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdssagatfvsgadavikltglvtlttsafatevltl
a

  • Chain 'D':
    Sequence, based on SEQRES records:
    >6p5tD (D:)
mtmitnsrgslsdgalstdnaagvnlftaypssgvsgstlslttgtdtltgtanndtfva
gevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptgvtisgietmnvtsgaaitlnts
sgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaannvavdgganvtvastgvtsgtt
tvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtvaqtagnavnttltqadvtvtgns
sttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasattagkiatvtlgsfgaatidssa
lttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltttgaitdseaaaddgfttiniag
stasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltgitvtnsvgatlgaelatglvft
ggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsad
pafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagattftnvavnvgltvlaaptgtttv
tlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvniaatdtnttahvdtltlqatsaks
ivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvsanttvgevvtirggagadsltg
satandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdinaigtstafvtitdaavgdkldl
vgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdss
agatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

    Sequence, based on observed residues (ATOM records):
    >6p5tD (D:)
vsgstlslttgtdtltgtanndtfvagevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavta
lptgvtisgietmnvtsgaaitlntssgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaa
qaannvavdgganvtvastgvtsgtttvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggta
vtvaqtagnavnttltqadvtvtgnssttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaa
asattagkiatvtlgsfgaatidssalttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvn
gltttgaitdseaaaddgfttiniagstasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaa
altgitvtnsvgatlgaelatglvftggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlg
aggsvnggdgtdvlvanvngssfsadpafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgata
gattftnvavnvgltvlaaptgtttvtlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvet
vniaatdtnttahvdtltlqatsaksivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsav
tfvsanttvgevvtirggagadsltgsatandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadi
fdinaigtstafvtitdaavgdkldlvgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaa
agdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdssagatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

  • Chain 'E':
    Sequence, based on SEQRES records:
    >6p5tE (E:)
mtmitnsrgslsdgalstdnaagvnlftaypssgvsgstlslttgtdtltgtanndtfva
gevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptgvtisgietmnvtsgaaitlnts
sgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaannvavdgganvtvastgvtsgtt
tvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtvaqtagnavnttltqadvtvtgns
sttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasattagkiatvtlgsfgaatidssa
lttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltttgaitdseaaaddgfttiniag
stasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltgitvtnsvgatlgaelatglvft
ggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsad
pafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagattftnvavnvgltvlaaptgtttv
tlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvniaatdtnttahvdtltlqatsaks
ivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvsanttvgevvtirggagadsltg
satandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdinaigtstafvtitdaavgdkldl
vgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdss
agatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

    Sequence, based on observed residues (ATOM records):
    >6p5tE (E:)
gvsgstlslttgtdtltgtanndtfvagevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavt
alptgvtisgietmnvtsgaaitlntssgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltatta
aqaannvavdgganvtvastgvtsgtttvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggt
avtvaqtagnavnttltqadvtvtgnssttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsa
aasattagkiatvtlgsfgaatidssalttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnv
ngltttgaitdseaaaddgfttiniagstasstiaslvaadattlnisgdarvtitshta
aaltgitvtnsvgatlgaelatglvftggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatl
gaggsvnggdgtdvlvanvngssfsadpafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgat
agattftnvavnvgltvlaaptgtttvtlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagve
tvniaatdtnttahvdtltlqatsaksivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsa
vtfvsanttvgevvtirggagadsltgsatandtiiggagadtlvytggtdtftggtgad
ifdinaigtstafvtitdaavgdkldlvgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaa
aagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdssagatfvsgadavikltglvtlttsafatevltl
a

  • Chain 'F':
    Sequence, based on SEQRES records:
    >6p5tF (F:)
mtmitnsrgslsdgalstdnaagvnlftaypssgvsgstlslttgtdtltgtanndtfva
gevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaavtalptgvtisgietmnvtsgaaitlnts
sgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltattaaqaannvavdgganvtvastgvtsgtt
tvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtggtavtvaqtagnavnttltqadvtvtgns
sttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitdsaaasattagkiatvtlgsfgaatidssa
lttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltlnvngltttgaitdseaaaddgfttiniag
stasstiaslvaadattlnisgdarvtitshtaaaltgitvtnsvgatlgaelatglvft
ggagadsillgattkaivmgagddtvtvssatlgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsad
pafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlgatagattftnvavnvgltvlaaptgtttv
tlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagvetvniaatdtnttahvdtltlqatsaks
ivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgsavtfvsanttvgevvtirggagadsltg
satandtiiggagadtlvytggtdtftggtgadifdinaigtstafvtitdaavgdkldl
vgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqyldaaaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdss
agatfvsgadavikltglvtlttsafatevltla

    Sequence, based on observed residues (ATOM records):
    >6p5tF (F:)
sgvsgstlslttgtdtltgtanndtfvagevagaatltvgdtlsggagtdvlnwvqaaav
talptgvtisgietmnvtsgaaitlntssgvtgltalntntsgaaqtvtagagqnltatt
aaqaannvavdgganvtvastgvtsgtttvgansaasgtvsvsvanssttttgaiavtgg
tavtvaqtagnavnttltqadvtvtgnssttavtvtqtaaatagatvagrvngavtitds
aaasattagkiatvtlgsfgaatidssalttvnlsgtgtslgigrgaltatptantltln
vngltttgaitdseaaaddgfttiniagstasstiaslvaadattlnisgdarvtitsht
aaaltgitvtnsvgatlgaelatglvftggagadsillgattkaivmgagddtvtvssat
lgaggsvnggdgtdvlvanvngssfsadpafggfetlrvagaaaqgshnangftalqlga
tagattftnvavnvgltvlaaptgtttvtlanatgtsdvfnltlsssaalaagtvalagv
etvniaatdtnttahvdtltlqatsaksivvtgnaglnltntgntavtsfdasavtgtgs
avtfvsanttvgevvtirggagadsltgsatandtiiggagadtlvytggtdtftggtga
difdinaigtstafvtitdaavgdkldlvgistngaiadgafgaavtlgaaatlaqylda
aaagdgsgtsvakwfqfggdtyvvvdssagatfvsgadavikltglvtlttsafatevlt
la